Mugen tsukuyomi sudah diaktifkan dan umat manusia terperangkap di dunia mimpi. Kaguya yang bangkit lewat Zetsu hitam mengisap semua cakra dan mulai beraksi! Dengan kekuatan yang diwariskan Ridudo Sennin, Naruto dan Sasuke menghadapi Kaguya yang harus disegel!!
Kaguya berhasil disegel dan perang besar pun berakhir. Namun, Sasuke memulai pemberontakan! Demi menyampaikan perasaan mereka yang selalu bertentangan, Naruto dan Sasuke pun saling berhadapan. Inilah akhir pertarungan yang mempertaruhkan segalanya di antara dua orang Pahlawan!
"Kalau begitu, jadi lebih kuat dari itu juga beres, kan!?"... Kakashi meenyarankan metode latihan yang mengejutkan pada Naruto yang tidak bisa membawa Sasuke kembali karena perbedaan kekuatan yang begitu besar! Di saat yang sama, duo baru Akatsuki terus mendekat ke negara 'Hi'...!!
Untuk memancing Naruto ke medan pereang, Madara mengacaukan situasi garis depan dengan kemampuan Zetsu Putih. Naruto yang bisa mendeteksi musuh pun bergegas ke semua lokasi pertempuran untuk menolong teman-temannya! Sementara itu, Gaara dan Onoki harus menghadapi para Kage terdaulu!
Naruto mulai berlatih setelah bertemu dengan Sennin Katak misterius sebelum babak utama 'tes ketiga'. Di waktu yang berbeda, Dosu yang menantang Gaara dikalahkan dalam sekejap...Sementara, terdi sesuatu antara Kabuto dan Baki si Jaonin dari Suna!! Kini, perjanjian yang mengerikan mulai terlihat!!
Naruto dan B bertarung sengit melawan 6 biju. Kakashi dan Guy pun datang membantu, tapi Naruto ditelan Yonbi. Dalam perut Yonbi, Naruto bertemu wujud asli biju bernama Son Goku! Di lain pihak, Sasuke akhirnya bergerak!
Saat Naruto dan kawan-kawannya mengira sudah berhasil mendapatkan peti mati tempat Sasuke tertidur, muncul musuh baru, Kimimaro!! Naruto VS Kimimaro, Shikamaru VS Tayuya, serta Kiba dan Akamaru VS Sakon. Tiga pertarungan sampai mati pun dimulai! Wahai orang-orang yang penuh semangat, perhatikan pertarungan ini!!
Kelima Kage bahkan tak mampu menahan Madara Uchiha karena perbedaan kekuatan yang begitu besar dan Tsunade akhirnya memutuskan untuk melanggar peraturan ninja medis! Sementara itu, Itachi dan Sasuke menghadapi Kabuto untuk menghentikan edo tensei. Perang terus berlanjut dan pertempuran gabungan yang ditakdirkan pun dimulai!!
Menuju akhir pertarungan sampai mati! Akhirnya, Sasori yang mengubah tubuhnya jadi Kagutsu atas kemauannya sndiri terus menyerang Sakura dan Nenek Chiyo. Pertarungan Naruto dan Kakashi yang mengejar Deidara juga akan selesai dengan sharingan yang baru!?
Para shinobi hampir menyerah di hadapan kekuatan Obito yang begitu dahsyat. Untung Naruto berhasil mencegahnya dengan menyampaikan tekadnya! Sementara di medan perang, seluruh pasukan mengerahkan tenaga bersama 5 Kage untuk menghadapi Shinju! Di lain pihak, Naruto dan Sasuke menggabungkan dua kekuatan untuk menghentikan mugen tsukuyomi milik Obito!
Dengan rinne fensei no jutsu, Madara kembali mendapatkan tubuh aslinya! Lalu, Naruto bekerja sama dengan para Biju untuk menghadapinya, tapi Madara berhasil mendapatkan mata kanannya dari Zetsu putih. Gedomazo yang kembali dipanggil pun menarik biju dan merebut Kurama dari tubuh Naruto!
Untuk melindungi teman-temannya dari kekuatan besar Madara dan kawan-kawan, Naruto mengerahkan kekuatan cakra kyubi. Tapi, daya penghancur jubi yang dahsyat trus mendesak tentara gabungan shonobi. Saat mereka sedang terdesak, bantuan terkuat akhirnya tiba di medan perang!
Kakashi goyah begitu menghetahui identitas si laki-laki bertopeng ternyata Obilo, teman lamanya. Untungnya, kalimat "Aku takkan membiarkan teman-temanku terbunuh!!" dari Naruto kembeli membangkitkan semangatnya! Naruto dkk pun mengerahkan serangan! Tapi, Jubi akhirnya berhasil dibangkitkan!!?
Dengan empat orang teman, termasuk Jugo si original dari 'Segel Gaib', Sasuke membentuk tim inti untuk mencapai tujuannya! Konoha mencium gerakan itu. 'Akatsuki' juga memperkuat kewaspadaannya terhadap Konoha yang sudah mengetahui gerakan itu. Naruto yang mengetahui target sasuke itu Itachi, bergerak bersama tim inti baru!!
Untuk menghadapi Madara yang sudah mengisap semua biju, Guy membuka Shimon, gerbang terakhir dari hachimontonko no jin! Apakah satu serangan yang melambangkan jalan ninjanya akan mempan pada Madara!? Sementara itu, Naruto yang berada di ambang kematian bertemu dengan Rikudo Sennin di alam bawah sadarnya.
Menuju akhir pertarungan sampai mati! Akhirnya, Sasori yang mengubah tubuhnya jadi Kugutsu atas kemauannya sendiri terus menyerang Sakura dan Nenek Chiyo. Pertarungan yang gagah berani akan menuju pukulan akhir...Lalu, pertarungan Naruto dan Kakashi yang mengejar Deidara juga akan selesai dengan sharingan yang baru???
Kakashi goyah begitu mengetahui identitas si laki-laki bertopeng ternyata Obito, teman lamanya. Untungnya, kalimat "Aku takkan membiarkan teman-temanku terbunuh!!" dari Naruto kembali membangkitkan semangatnya! Naruto dkk pun mengerahkan serangan! Tapi, Jubi akhirnya berhasil dibangkitkan!!?
Sasuke mengetahui perasaan sang kakak dan memutuskan jalannya sendiri! Dia bekerja sama dengan Akatsuki yang punya satu tujuan dan pergi menangkap Biju. Di lain pihak, berita kematian Jiraiya telah disampakan oleh Sennin Katak ke desa Konoha. Bagaimanakah reaksi Naruto saat mendengar kematian gurunya!?
Demi membebaskan Gaara yang ditangkap, Naruto dan yang kawan-kawan mengincar tempat persembuyian Akatsuki! Tapi, sebelum itu, mereka harus menghadapi litachill di pihal lain, Kisame muncul di hadapan kelompok Gy yang bergerak di tempat lain!! Bagaimanakah akhir dari takdir Gaara